Protein–RNA interactions for Protein: Q9R014

Ctsj, Cathepsin J, mousemouse

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtsjQ9R014 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
CtsjQ9R014 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Zmym3-207ENSMUST00000120201 1859 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
CtsjQ9R014 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms