Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM4

Tnfrsf10b, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 10B, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Tnfrsf10bQ9QZM4 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Tnfrsf10bQ9QZM4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms