Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Irx4Q9QY61 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Irx4Q9QY61 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.3 ms