Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA7

Trim44, Tripartite motif-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim44Q9QXA7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim44Q9QXA7 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim44Q9QXA7 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim44Q9QXA7 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms