Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME7

Trappc2l, Trafficking protein particle complex subunit 2-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2lQ9JME7 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Trappc2lQ9JME7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Trappc2lQ9JME7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms