Protein–RNA interactions for Protein: Q9JM73

Srf, Serum response factor, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrfQ9JM73 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Alg1-201ENSMUST00000049207 1669 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SrfQ9JM73 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SrfQ9JM73 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
SrfQ9JM73 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms