Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL70

Fanca, Fanconi anemia group A protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,439 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FancaQ9JL70 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FancaQ9JL70 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FancaQ9JL70 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FancaQ9JL70 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms