Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP8

Chrac1, Chromatin accessibility complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrac1Q9JKP8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Chrac1Q9JKP8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Chrac1Q9JKP8 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.3 ms