Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK0

Rcan3, Calcipressin-3, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcan3Q9JKK0 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Rcan3Q9JKK0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Rcan3Q9JKK0 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rcan3Q9JKK0 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms