Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trem3Q9JKE1 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trem3Q9JKE1 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms