Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJR7

Ascl3, Achaete-scute homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ascl3Q9JJR7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ascl3Q9JJR7 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ascl3Q9JJR7 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms