Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF9

Ly96, Lymphocyte antigen 96, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ly96Q9JHF9 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly96Q9JHF9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly96Q9JHF9 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly96Q9JHF9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ly96Q9JHF9 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly96Q9JHF9 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly96Q9JHF9 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly96Q9JHF9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly96Q9JHF9 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly96Q9JHF9 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Ly96Q9JHF9 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ly96Q9JHF9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms