Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX4

Zcchc17, Nucleolar protein of 40 kDa, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc17Q9ESX4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Zcchc17Q9ESX4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Ppm1n-201ENSMUST00000032560 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Zcchc17Q9ESX4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Zcchc17Q9ESX4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 143 ms