Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Sp6Q9ESX2 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Sp6Q9ESX2 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms