Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC35.59■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC35.58■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.58■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.29
Rb1cc1Q9ESK9 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC35.56■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm26971-201ENSMUST00000182423 1072 ntBASIC35.55■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.55■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.54■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC35.53■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.53■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC35.52■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC35.51■■■■□ 3.28
Rb1cc1Q9ESK9 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ube2d-ps-204ENSMUST00000137510 1846 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC35.51■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35.51■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC35.5■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.5■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC35.46■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43672-201ENSMUST00000199072 1731 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC35.45■■■■□ 3.27
Rb1cc1Q9ESK9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 9430060I03Rik-201ENSMUST00000191563 1689 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.44■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC35.43■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Rb1cc1Q9ESK9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.6 ms