Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK7

Chrnb2, Neuronal acetylcholine receptor subunit beta-2, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrnb2Q9ERK7 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Chrnb2Q9ERK7 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Chrnb2Q9ERK7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms