Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER88

Dap3, 28S ribosomal protein S29, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dap3Q9ER88 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Dap3Q9ER88 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Dap3Q9ER88 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms