Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCZ9

Aph1c, Putative gamma-secretase subunit APH-1C, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aph1cQ9DCZ9 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
Aph1cQ9DCZ9 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Aph1cQ9DCZ9 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms