Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

Predictions only

Length 238 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan4Q9DCK3 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Tspan4Q9DCK3 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Tspan4Q9DCK3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms