Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG1

Cyp27a1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp27a1Q9DBG1 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Cyp27a1Q9DBG1 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 0610010K14Rik-208ENSMUST00000108578 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cyp27a1Q9DBG1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Fam53a-202ENSMUST00000065119 2009 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cyp27a1Q9DBG1 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms