Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Med27Q9DB40 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Med27Q9DB40 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms