Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAE8

UPF0739 protein C1orf74 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAE8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAE8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAE8 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAE8 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms