Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAC0

Cmtm2b, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm2bQ9DAC0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Cmtm2bQ9DAC0 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cmtm2bQ9DAC0 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms