Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9S1

UPF0193 protein EVG1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D9S1 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9S1 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9S1 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9S1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9S1 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D9S1 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Q9D9S1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9S1 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Q9D9S1 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Q9D9S1 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms