Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC18.64■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
Fip1l1Q9D824 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Fip1l1Q9D824 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.4 ms