Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6J5

Ndufb8, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 8, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb8Q9D6J5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufb8Q9D6J5 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Ndufb8Q9D6J5 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms