Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U5

Pudp, Pseudouridine-5'-phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PudpQ9D5U5 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
PudpQ9D5U5 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Gas2l1-203ENSMUST00000109895 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PudpQ9D5U5 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms