Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5U0

Lpcat2b, Lysophosphatidylcholine acyltransferase 2B, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lpcat2bQ9D5U0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Lpcat2bQ9D5U0 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Lbx2-201ENSMUST00000041265 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Lpcat2bQ9D5U0 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms