Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5F6

4930447A16Rik, RIKEN cDNA 4930447A16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447A16RikQ9D5F6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
4930447A16RikQ9D5F6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Oxct2a-201ENSMUST00000102640 1760 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Nkiras2-203ENSMUST00000107376 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4930447A16RikQ9D5F6 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms