Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lonrf3Q9D4H7 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Lonrf3Q9D4H7 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lonrf3Q9D4H7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms