Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D5

4933414I15Rik, RIKEN cDNA 4933414I15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933414I15RikQ9D4D5 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
4933414I15RikQ9D4D5 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
4933414I15RikQ9D4D5 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37 ms