Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3G5

Stx11, Syntaxin-11, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx11Q9D3G5 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Stx11Q9D3G5 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx11Q9D3G5 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx11Q9D3G5 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx11Q9D3G5 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx11Q9D3G5 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx11Q9D3G5 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx11Q9D3G5 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx11Q9D3G5 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx11Q9D3G5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx11Q9D3G5 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx11Q9D3G5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx11Q9D3G5 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Stx11Q9D3G5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms