Protein–RNA interactions for Protein: Q9D358

Acp1, Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase, mousemouse

Predictions only

Length 158 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acp1Q9D358 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Acp1Q9D358 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Acp1Q9D358 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms