Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1K2

Atp6v1f, V-type proton ATPase subunit F, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp6v1fQ9D1K2 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Atp6v1fQ9D1K2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Atp6v1fQ9D1K2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms