Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0U9

Arv1, Protein ARV1, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arv1Q9D0U9 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Gm10575-201ENSMUST00000097947 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Arv1Q9D0U9 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Arv1Q9D0U9 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms