Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0R8

Lsm12, Protein LSM12 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm12Q9D0R8 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Lsm12Q9D0R8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Lsm12Q9D0R8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms