Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ6

Mis18a, Protein Mis18-alpha, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mis18aQ9CZJ6 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Mis18aQ9CZJ6 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Mis18aQ9CZJ6 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms