Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZJ1

Utp11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Utp11Q9CZJ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Btnl9-202ENSMUST00000066531 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Utp11Q9CZJ1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Utp11Q9CZJ1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms