Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYZ8

Ssbp2, Single-stranded DNA-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp2Q9CYZ8 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Mrpl3-205ENSMUST00000149243 2309 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Rcan3-201ENSMUST00000030606 5111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Ssbp2Q9CYZ8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ssbp2Q9CYZ8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms