Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYW4

Hdhd3, Haloacid dehalogenase-like hydrolase domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdhd3Q9CYW4 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Golga7b-202ENSMUST00000122375 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Hdhd3Q9CYW4 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Hdhd3Q9CYW4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms