Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Xrcc3Q9CXE6 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xrcc3Q9CXE6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
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