Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUB6

Otud1, OTU domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud1Q9CUB6 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Rasl10a-201ENSMUST00000037218 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Otud1Q9CUB6 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Lhx1-204ENSMUST00000184646 1201 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 En2-201ENSMUST00000036177 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Otud1Q9CUB6 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms