Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Pard3bQ9CSB4 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Gm10033-202ENSMUST00000211874 928 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Pard3bQ9CSB4 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pard3bQ9CSB4 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pard3bQ9CSB4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Pard3bQ9CSB4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms