Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR05

4931417E11Rik, RIKEN cDNA 4931417E11, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931417E11RikQ9CR05 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
4931417E11RikQ9CR05 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
4931417E11RikQ9CR05 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms