Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Trappc2Q9CQP2 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms