Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI7

Snrpb2, U2 small nuclear ribonucleoprotein B'', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpb2Q9CQI7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Snrpb2Q9CQI7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.52■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Snrpb2Q9CQI7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88 ms