Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE1

Nipsnap3b, Protein NipSnap homolog 3B, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3bQ9CQE1 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Nipsnap3bQ9CQE1 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms