Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQC3

Protein C9orf135 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQC3 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Igfbp6-201ENSMUST00000023807 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Ldb1-201ENSMUST00000026252 1718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Q9CQC3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Myd88-201ENSMUST00000035092 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Q9CQC3 6030419C18Rik-201ENSMUST00000085658 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQC3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQC3 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Q9CQC3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms