Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ46

Efcab2, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efcab2Q9CQ46 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Efcab2Q9CQ46 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab2Q9CQ46 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab2Q9CQ46 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab2Q9CQ46 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab2Q9CQ46 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab2Q9CQ46 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab2Q9CQ46 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab2Q9CQ46 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Efcab2Q9CQ46 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Efcab2Q9CQ46 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Efcab2Q9CQ46 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.5 ms