Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Relb-202ENSMUST00000094762 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Relb-203ENSMUST00000098754 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Exoc5-206ENSMUST00000161504 2582 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Commd4Q9CQ02 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Commd4Q9CQ02 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms